Prima di passare al trapianto è necessario eliminare completamente il midollo malato con chemioterapia e/o radioterapia (regime di condizionamento).
Il midollo prelevato dal donatore deve essere trapiantato entro 24/48 ore.
Il trapianto avviene con infusione venosa come per la trasfusione di sangue.
Le cellule midollari riescono da sole a trovare la loro sede naturale ed iniziare a moltiplicarsi.
Dopo circa 14 giorni nella circolazione sanguinea cominciano a comparire i primi nuovi globuli bianchi a cui seguiranno globuli rossi e piastrine.